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toc總有機碳分析的主要特征

  • 時間:2020-04-18
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中心是一個集儀器設(shè)備的使用、方法開發(fā)、技術(shù)服務于一體的平臺,一方面支撐科學研究順利實施,另外一方面中心本身也是新技術(shù)新方法的“搖籃”。所以,中心提出了以“出”技術(shù)“出”方法,來促進科研的“出”人才“出”成果。從一個數(shù)據(jù)來看,2014年到2017年,中心的儀器設(shè)備使用機時每年以將近2萬個小時增長,使用率也以30%左右的比例逐年穩(wěn)步提高。在這樣的技術(shù)支撐下,中心的用戶取得了非常好的、突破性的科研成果。從生化與細胞所本身來講,7年間有6項成果入選了中國科學十大進展;簡單統(tǒng)計,自2000年至2017年,研究所所發(fā)SCI論文大概有1000多篇,其中2017年更是“井噴式”發(fā)展,發(fā)表SCI論文近150篇。

  研究所在中科院的支持下通過功能開發(fā)項目資助的方式來提升平臺的專業(yè)技術(shù)水平。在幾位老師介紹中,toc總有機碳分析讓編者印象深刻的有兩個項目,分別是2015-2016年的“提高高壓冷凍及冷凍替代技術(shù)電鏡制樣成功率的開發(fā)”項目和2016-2017年的“液體工作站用于自動化的二代測序文庫構(gòu)建的功能開發(fā)”項目。

  高壓冷凍制樣是國際前沿的技術(shù),toc總有機碳分析不過其運行消耗非常大,一次實驗就需要幾百升液氮,樣品的成功率卻又很低,使得大部分人并不首選去做這個實驗。但是,這個實驗的好處也很明顯,即在瞬間超過冰點-190多度的溫度、高壓狀態(tài)下,能夠“高保真”的保持生物樣品的超微結(jié)構(gòu)和活性。“平臺2011年建立電鏡分析系統(tǒng)時,也買了高壓冷凍儀和冷凍替代儀,那么,我們也就想一定要把方法建立起來。”邊瑋介紹到,“這個過程中我們不斷摸索,如根據(jù)儀器、樣品的特色,我們不斷自創(chuàng)小設(shè)備、改進技術(shù)方法等。該項目完成之后制樣成功率提高了三倍左右。”

  對于自動化液體工作站項目,陳銘介紹到,最近兩年單細胞生物學特別熱門,經(jīng)常會有非常好的文章發(fā)表。toc總有機碳分析但是在它的研究過程中經(jīng)常會遇到一些問題,如現(xiàn)有的高通量測序的商業(yè)化設(shè)備可以對單細胞做一些特性、基因表達的鑒定,但它需要做到至少幾萬個細胞的規(guī)模,并且也只能提供一些通用的解決方案。實際上,如今有很多研究工作研究的細胞數(shù)量特別少,也就是說用常規(guī)設(shè)備是沒法做的。另外,如在腫瘤臨床樣本研究時還需要獲得細胞的空間等信息。針對這些需求,陳銘他們采用了一些不同的方式,如利用流式分選把相同的細胞分開;利用激光顯示切割的方式把腫瘤組織上的、明確的細胞挑出來;通過在硬件、軟件上做些實驗條件的優(yōu)化,實現(xiàn)了自動化和單細胞測序建庫的銜接。之前,手工去做的話,需要兩個人四天才能完成一塊96孔板細胞的實驗操作,而在自動化工作站上去做的話,只要16個小時就可以做完,而且成功率大幅提高,高達95%以上。


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